«Роскосмос» сообщил, что после завершения общей сборки и доставки ракеты-носителя «Союз-2.1а» с кораблём «Прогресс МС-16» на борту, Центр управления полётами (ЦУП) завершил плановые работы по подготовке к выведению на орбиту «грузовика» и последующей стыковке к российскому сегменту МКС. В настоящее время старт запланирован на 15 февраля 2021 года в 7:45 по московскому времени. Отделение «грузовика» от третьей ступени ракеты-носителя «Союз-2.1а» состоится менее чем через 9 минут, а стыковка со станцией запланирована на 17 февраля в 9:20 по московскому времени, по двухсуточной (34-витковой) схеме. Сближение корабля со станцией и причаливание к стыковочному узлу модуля «Пирс» пройдут в автоматическом режиме под контролем специалистов ЦУП и российских членов экипажа станции, космонавтов Сергея Рыжикова и Сергея Кудь-Сверчкова.